Virüsler, biyolojinin canlı ve cansız arasındaki sınırını sorgulatan en ilginç yapılar arasında yer alır. Genetik materyallerini bir protein kılıf içinde taşıyan bu organizmalar, kendi başlarına çoğalamaz; konak hücrelerin metabolik mekanizmalarını kullanarak varlıklarını sürdürebilirler. Bu özellikleriyle yalnızca enfeksiyonlara değil, aynı zamanda moleküler biyolojideki temel araştırmalara da ilham kaynağı olmuşlardır.
Tarih boyunca insanlık birçok pandemiye tanıklık etti. 1918’de başlayan İspanyol Gribi, HIV/AIDS salgını ve 2009’daki H1N1 pandemisinin ardından, 2019 yılında ortaya çıkan SARS-CoV-2 pandemisi, küresel ölçekte sağlık sistemlerini ve bilimsel öncelikleri köklü şekilde değiştirdi. Özellikle COVID-19, virüslerin moleküler düzeyde tanılanması gerekliliğini ve tanı teknolojilerindeki hassasiyet ihtiyacını bir kez daha gün yüzüne çıkardı. Salgının ilk aylarında virüsün yayılım hızıyla tanı kapasitesi arasında büyük bir uyumsuzluk yaşanmış; bu da doğru, hızlı ve güvenilir moleküler tanı yöntemlerinin ne kadar kritik olduğunu açıkça ortaya koymuştur.
Viral enfeksiyonların saptanmasında klinik semptomlar çoğu zaman yetersiz kalır. Bu nedenle, enfeksiyonların moleküler düzeyde tanımlanması; hem hastalıkların teşhisi hem de yayılımın takibi açısından vazgeçilmezdir. Moleküler tanı sürecinin ilk ve en kritik adımı ise virüsün genetik materyali olan RNA veya DNA’nın güvenilir bir şekilde izole edilmesidir. Tanının başarısı, bu aşamada elde edilen nükleik asidin saflığına ve bütünlüğüne doğrudan bağlıdır.
Bu noktada, Norgen Biotek ve Roche Diagnostics, viral nükleik asit izolasyonuna yönelik geliştirdikleri kitlerle araştırmacılar için güvenilir ve etkili çözümler sunar. Norgen’in spin kolon tabanlı izolasyon kitleri, farklı örnek türleriyle (kan, plazma, tükürük, idrar gibi) uyumlu çalışabilme esnekliği ve yüksek verim sağlamasıyla öne çıkar. Patentli reçineleri sayesinde RNA ve DNA’yı aynı anda izole etme imkânı sunar; bu da zamandan tasarruf ve analiz hassasiyetinde artış anlamına gelir. Roche’un High Pure Viral Nucleic Acid Kit gibi ürünleri ise güçlü lizis tamponları ve yüksek bağlama kapasiteli cam fiber filtreleri sayesinde, özellikle düşük kopya sayısına sahip viral örneklerde dahi etkin izolasyon sağlayarak downstream analizlerde güvenilirlik sunar. Her iki markanın ürünleri, özellikle inhibitörlerin uzaklaştırılmasındaki başarısı ve otomasyon sistemlerine entegrasyon kolaylığıyla rakiplerinden ayrışır. Bu nedenle moleküler tanının temelini oluşturan izolasyon süreci, hatasız ve tekrarlanabilir sonuçların ilk adımıdır.
İzolasyonun ardından gelen qPCR (kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu) ve dPCR (dijital PCR) teknolojileri ise günümüzde viral tanının iki temel direği olarak konumlanır. qPCR, hedef nükleik asit dizilerinin çoğaltılmasını ve eş zamanlı olarak floresan sinyaller aracılığıyla kantifikasyonunu sağlar. Yüksek özgüllük ve hassasiyet sunması, onu pandemiler sırasında birincil tanı yöntemi haline getirmiştir. Bununla birlikte, qPCR analizleri genellikle standart eğriler üzerinden kantifikasyon yaptığı için düşük viral yüklerde duyarlılığı sınırlı olabilir.
Bu sınırlamaları aşmak için geliştirilen dijital PCR (dPCR) teknolojisi ise numuneyi binlerce küçük bölmeye ayırarak her birinde ayrı PCR reaksiyonları gerçekleştirir. Bu sayede kantifikasyon, standart eğriden bağımsız olarak mutlak düzeyde yapılabilir. PubMed’deyayımlanan çok sayıda çalışma, dPCR’ın SARS-CoV-2’nin presemptomatik bireylerde bile güvenilir şekilde saptanmasında önemli avantajlar sunduğunu göstermektedir. Ayrıca HIV, HBV ve HCV gibi kronik viral enfeksiyonlarda tedavi sonrası rezidüel viral yükün izlenmesi gibi hassasiyet gerektiren durumlarda, dPCR teknolojisi yüksek çözünürlüklü veri üretimi ile öne çıkar.
Her iki yöntem de kendi içinde güçlü avantajlara sahip olsa da, uygulamaya ve ihtiyaca göre bazı sınırlılıklarla gelir. qPCR, daha düşük maliyetli, yüksek throughput kapasitesine sahip ve hızlı sonuç veren bir teknolojidir. Buna karşılık dPCR, yüksek hassasiyet sunmasına rağmen, daha uzun analiz süresi, sınırlı örnek kapasitesi ve daha yüksek maliyet gibi zorluklar barındırır.
Letgen ailesi olarak, biz bu teknolojilerin potansiyelini ve laboratuvar koşullarının ihtiyaçlarını çok iyi biliyoruz. Bu nedenle yalnızca dijital PCR altyapımızı araştırmacıların hizmetine sunmakla kalmıyor; aynı zamanda projelerinize özel, bilimsel değer katan çözümler üretiyoruz. Mutlak kantifikasyon gücüne sahip dPCR platformumuzu projelerinizde kullanarak, verinizi güvenle yorumlayabilir, analizlerinizi daha hassas hale getirebilirsiniz. Ayrıca viral çalışmalarınızda ihtiyaç duyduğunuz Roche ve Norgen izolasyon kitlerine Letgen üzerinden kolayca ulaşabilirsiniz. Hızlı teslimat garantimizle, araştırmanızın ritmini bozmadan tüm süreci destekliyor; sizi yalnızca doğru ürünle değil, zamanında ulaşan güvenle de buluşturuyoruz.
Çünkü biz, bir tedarikçiden öte, bilimsel yolculuğunuzun gerçek bir paydaşıyız.